В съответствие с Правилника, РСРЗ изпълнява следните задачи:

1. Организира, ръководи и контролира дейността на системата по диагностика, прогноза и сигнализация на вредителите по селскостопанските култури;

2. Подготвя и издава бюлетини на регионално ниво с информация и препоръки за опазване на земеделските култури;

3. Организира и ръководи фитосанитарния контрол при вноса, износа и транзита на растения и растителни продукти;

4. Организира и ръководи фитосанитарния контрол при производство на растения и растителни продукти и издава съответните документи;

5. Регистрира, контролира и лицензира лицата, които внасят, продават, разфасоват и опаковат продукти за растителна защита с търговска цел или извършват растителнозащитни услуги.